断开饮水机的电源，取下水桶，将饮水机里残留的水放干净。打开卡桶的塑料盖，往里面倒入白醋水。插上饮水机电源，加热四十分钟左右，打开水龙头或排水口将其排出，再用同样的方法倒入清水反复加热清洁即可。
不要用清洁剂来清洗饮水机，如果清洗不干净,清洁剂很可能会残留在饮水机内。
用棉花蘸上酒精，轻轻的擦洗龙头处的后壁和下方，因为用杯子盛水时，很容易碰到饮水机开关处的后壁和下方，所以不能只用抹布擦洗。
饮水机最脏的部位其实是位于冲瓶座下面的水胆，因为每次换水都会有水残留在那里，形成死水，成为滋生细菌的温床。另外，在纯净水的加热过程中，会有矿物质析出，在饮水机内胆形成垢壁。
除了一般的饮水机，净水器是更大的藏污纳垢器，超过三个月不清洗远比未经过净化的自来水包含更多细菌。