1、可引导的句子不同
nomatter what只能引导让步状语从句。
例句：Nomatterwhatyousay，Iwon'tbelieveyou．
无论你说什么我也不会相信的。
在引导名词性从句（如主语从句、宾语从句、表语从句），则只用whatever。
例句：Whateverhedidwasright．
无论他做什么都是对的。
2、语气程度不同
whatever还可用于加强语气，相当于what ever, what on earth等。no matter没有这种用法。
如：Whatever is the matter?
这是怎么回事?
3、从句动词不同
有时no matter what引导的从句中，动词可以省略。
例句：Inourcompany,everybodyiswelltakencareof,nomatterwhathisposition(is).
在我们公司，每个人都得到很好的照顾，不管他地位如何。