当我们吃东西的时候，食物先从嘴，经食道往下移，然后进入胃。食物经由食道一路下去，在要进入胃时，会通过一片单项的活门，称作食道下端括约肌，这一片肌肉就是食道与胃之间的一道单向活门。在正常情况下，当我们吞咽时，这片活门口就会打开。在食物进入胃里后，这片肌肉活门又会关闭起来。当肌肉活门无法正常运作时，就会产生胃酸倒流的症状。由于活门不正常的开合，使得胃里的食物和胃酸逆流进食道里去。
2、胃酸可倒流至气管，引起咳嗽；胃酸亦有可能刺激食道的交感神经，直接影响气管收缩，引起哮喘症状。胃酸倒流直接令食道受损，长期缺乏医治，有机会导致食道炎、食道溃疡，甚至引起巴洛氏食道癌的癌前病变，增加了患癌机会。
