佳木斯大学的校徽如下：
佳木斯大学所在城市是黑龙江省省域副中心城市，是全省东北部地区政治、经济、科技、文化教育、医疗、商贸和交通中心；环境绝佳，有“华夏东极”“东方第一城”“东北小延安”之称；交通日趋便利，是已开通的哈佳快速铁路和规划建设的沈佳高速铁路的东北方终点城市；战略位置重要，处于东北亚经济圈的中心位置，是中国通向俄罗斯西伯利亚和远东地区的桥头堡，也是亚欧、亚美的结合点，是对俄经贸合作的大通道。
学校始建于1947年，于1995年6月27日经原国家教委批准，由佳木斯医学院、佳木斯工学院、佳木斯师范专科学校和原佳木斯大学合并组成；2000年后，佳木斯市粮食职工中等专业学校、富锦师范学校、黑龙江省理工学校相继并入。