初期：通常发生在初次感染HIV后2-4周左右。临床主要表现为发热、咽痛、盗汗、恶心、呕吐、腹泻、皮疹、关节痛、淋巴结肿大及神经系统症状。有点多类似于发热感冒等症状，临床症状轻微，持续1-3周后会有一定的缓解。
中期：有些会是无明显症状，潜伏时间为6-8年。有些会进展快速，免疫系统会遭到逐步破坏。
晚期：进入HIV最后阶段主要表现为持续一个月以上的发热、盗汗、腹泻；体重减轻10%以上。部分病人表现为神经精神症状，例如记忆力减退、精神淡漠、性格改变、头痛、癫痫及痴呆等。另外还可出现持续性全身性淋巴结肿大等症状。