蝙蝠有矶窍崮冬眠的。
蝙蝠全身骨质轻，头骨愈合程度较高，肩带发达，胸骨具龙骨状突起。后肢胫骨、腓骨退化。耳壳发吾褴恶将达，常具发达的耳屏或对耳屏。翼膜、耳、唇等处有丰富的感觉毛。颜色多样，大多是褐色、灰色和黑色。
蝙蝠可携带多种人畜共患病毒，自身几乎不受感染。通过对相关基因的研究，科学家发现蝙蝠中NF-κB家族转录因子c-REL受到正选择。该基因不仅在固有免疫中发挥功能，还与DNA损伤反应具有一定关系。自然杀伤性（NK）细胞是抵抗外界病原微生物和肿瘤的第一道防线。
蝙蝠的头骨和牙齿的形状主要和所吃的食物有关。杂食的叶口蝠和食虫的圆耳蝠（四耳蝠属）有最普通的牙齿以便嚼碎食物，而大食果蝠有大而平的臼齿。吸食花蜜的无尾长舌蝠很少使用牙齿，然而它们的头骨被拉长以容下一条长而多毛的舌头。
普通吸血蝠凿子一样的门齿和竖向扁平像剃刀一样的上犬齿被用来在动物皮肤上咬开一个槽形切口，以便于它在里面舔食血液。肉食的假吸血蝠有巨大的头骨，强壮尖锐的犬齿和剪刀一样的日齿，可以削骨切肉。