1、厌氧段：发酵作用：在没有溶解氧和硝态氧存在的厌氧状态下，兼性细菌将溶解性BOD转化为低分子发酵产物挥发性脂肪酸。
2、好氧段：磷的吸收：细菌以聚磷的形式存贮超出生长需求的磷量，通过PHB/PHV的氧化代谢产生能量，用于磷的吸收和聚磷的合成，能量以聚磷酸高能键的形式富集存贮，磷酸盐从液相去除，合成新的贮磷菌细胞，产生富磷污泥。
3、除磷系统：剩余污泥排：通过剩余污泥排放，将磷从系统中除去。好氧吸收磷的前提条件是混合液必须经过磷的厌氧释放，在有效释放过程中，磷的厌氧释放可使微生物的好氧吸磷能力大大提高。
4、生物除磷典型工艺：生物除磷工艺形式多种多样，一般均含有依次排列的“厌氧——缺氧——好氧”除磷单元主要工艺有A/O、三级A2晦倘佳鳎O、改价Bardenpho、UTC工艺、SBR工艺、氧化沟工艺等等，注意除了AO工艺以为，其余均具备同时脱氮除磷的能力。