原因如下：
1、解旋酶一般只能打开很短一部分的DNA双螺旋，在具体PCR操作的时候无法控制其具体在什么时间。
2、不能保证DNA解旋酶解开DNA的那段时间足够长以便让引物和模板结合，而且引物和模板结合后，解旋酶还能立刻移开以免阻碍DNA合成酶的前进。
聚合酶链式反应为一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术，可看作是生物体外的特殊DNA复制，PCR的最大特点是能将微量的DNA大幅增加。
扩展资料：
标准的PCR过程分为三步：
1、DNA变性：（90℃-96℃）：双链DNA模板在热作用下，氢键断裂，形成单链DNA。
2、退火：（60℃-65℃）：系统温度降低，引物与DNA模板结合，形成局部双链。
3、延伸：（70℃-75℃）：在Taq酶（在72℃左右，活性最佳）的作用下，以dNTP为原料，从引物的3′端开始以从5′→3′端的方向延伸，合成与模板互补的DNA链。
参考资料来源：百度百科-聚合酶链式反应