1、办公区：即实验工作人员开展日常工作，记录、整理数据的主要场所，除实验方有特殊需求外，常见的办公区设计是设置在实验楼的最外层，与实验区域保持一定距离，家具设备只需有简单的桌椅、茶水等设施即可，也可根据实验方需求增设功能间。
2、细菌实验室：包括无菌室、细菌检验操作室、培养室、洗涤消毒间。无菌室用于处理样品和接种培养，要求通过空气净化等有效措施为微生物实验室提供一个相对无菌的工作环境。无菌实验室设计应满足如下要求：① 入口设置在细菌检测操作室内，避开走廊② 无菌室与操作室之间用缓冲间分隔，且要求有两道。③ 无菌室和缓冲间均应装有紫外灯，且要求每3平方米安装30W紫外灯一盏④ 无菌室内设有实验台（中央实验台与边台皆可），紫外灯距实验台面＜1.5m⑤ 无菌室与操作间之间设有双层窗构成小通道
3、细菌检验操作室主要用于细菌培养和检验，主要设施是实验台。实验台位置应在实验室中心位置，光线充足；实验台材料要耐热、耐酸碱。
4、培养室，即培养基制作室，主要用于制作、配制微生物培养所需的培养基及检验用试剂的场所，主要设备时边台和药品柜。在做培养室设计时要注意危险、易燃易腐、有毒有害物品应单独设保险柜存放。
5、洗涤消毒间主要用于清洗消毒实验用具、培养基等，面积≥10㎡。洗涤消毒间内常配置高压灭菌锅、通风装置（通风柜）或换气扇。有条件的实验方还应在室内设置供日常检验用水蒸馏水器装置。
6、理化实验室：理化分析室是物理化学分析的主要操作室。如果条件有限，也可将理化试验室设计成与微生物常规实验室合并。主要设备有实验台、通风柜、洗涤池等。实验台要求通细菌操作室相同。
